«Потерпи Господа, мужайся, и да крепится сердце твое, и потерпи Господа» (Пс.26:14)

Степан Константинович Пономарев ‒ будущий священномученик Стефан ‒ родился 14 декабря 1880 года в Алма-Ате. В 1895 году Степан окончил церковноприходскую школу. В 1904 году ‒ назначен псаломщиком. Вскоре женился.

В 1909 году Степан Константинович был рукоположен во диакона, а в 1914 ‒ во священника. В Первую Мировую войну он состоял священником при Красном Кресте.

Во время боевых действий долгое время находился в окопах. Весной дождь и мокрый снег наполняли окопы водой и грязью. Из окопов батюшку вытащили еле живого, доставили в госпиталь, где прооперировали. С тех пор священник всю жизнь страдал сильными головными болями.

По возвращении с фронта, отец Стефан был направлен служить в Николаевский храм Алма-Аты и был возведен в сан протоиерея. Отец Стефан был задумчив и молчалив, всегда погружен в молитву. Служил ежедневно, был аскетом, жил как строгий монах. «Боже упаси, ‒ говорил он, ‒ службу пропустить». Службы его были тихими, неторопливыми, проникновенными и благоговейными.

В 1923 году на архиерейскую кафедру в Семиречье ‒ часть Алматинской области — был назначен епископ Николай (Федотов), который в том же году перешёл в обновленческий раскол. В Вознесенском кафедральном соборе города Алма-Аты обновленцами был избран епископом Семиреченским вдовый протоиерей Алексей Марков. Из-за его активного сотрудничества с властями, Семиречье почти целиком стало обновленческим. На сторону обновленцев перешел весь клир кафедрального Вознесенского собора. Влияние обновленцев усиливалось. Несмотря на угрозы и сладкие обещания,  отец Стефан до конца остался верен Православной Церкви.

В 1927 году настоятель собора протоиерей Александр Скальский стал склоняться к переходу к обновленцам. Отец Стефан сказал ему, что сам в обновленчество не пойдёт и его не пустит. Скорбели об отце Александре и прихожане, молились и уговаривали опомниться.

Так настоятель томился, пока верующие его не вразумили. Одна из старейших прихожанок — бойкая, крепкая старушка, опиравшаяся  при ходьбе на палку — сказала ему всерьёз, что если он бросит своих прихожан и уйдёт к обновленцам, она его этой палкой отколотит в воспитательных целях как ребёнка. Замахнулась на него, и заплакала. Настоятель был сильно впечатлён этим эпизодом и образумился. Отец Стефан сказал, что хоть на деле тот и не принял обновленчество, но в мыслях принял, а значит не может служить пока не принесёт покаяние.

В ближайший праздничный день отец Александр перед Литургией принёс покаяние перед духовенством и паствой и стал служить вместе с отцом Стефаном.

К 1929 году почти все церкви в Алма-Ате были захвачены обновленцами и одна григорианцами. В 30-е годы Никольская церковь осталась единственным оплотом Православия в городе.

В это время в Алма-Ате был устроен пересыльный пункт ГПУ, куда отправляли заключенных со всей страны. Когда ссыльных было очень много и их негде было размещать, начальник ГПУ посылал их в Никольскую церковь, зная, что там принимают всех обездоленных. Не было ни одной ночи, чтобы в Никольском храме не ночевали ссыльные. Отец Александр из скудного церковного дохода выдавал деньги на помощь ссыльным, на эти средства им покупали еду, одежду и обувь.

10 декабря 1932 года отец Стефан был арестован в Никольском храме вместе с отцом Александром.

Месяц священника допрашивали в ГПУ. Потом направили в санпропускник. Там сильно напарили в бане, посадили в кузов открытого грузовика и повезли по морозу в городскую тюрьму. Сильно простуженный, он сразу заболел сыпным тифом и был отправлен в тифозный барак Красного Креста.

Скончался мученик в январе 1933 года в тифозном бараке в Алма-Ате. Погребён на лагерном кладбище в общей могиле.

Священномученик Стефан Пономарёв причислен к лику святых новомучеников и исповедников  в августе 2000 года.