Будущий священномученик Прокопий родился в 1864 году в с. Утманово Утмановской волости, в семье священника.

В 1884 году он окончил Вологодскую духовную семинарию. По окончании, был назначен надзирателем Вологодского духовного училища. В это время он познакомился с будущей супругой, и вскоре они обвенчались.

В декабре 1885 года Прокопий Попов был рукоположен в сан священника в Троицкой церкви с. Шолга.

О. Прокопий нёс множество церковно-общественных послушаний: был законоучителем, благочинным, попечителем земского училища. За всю свою священническую деятельность он всего два раза был в отпуске. Также занимался воспитанием детей. У супругов их было четверо.
В 1905 году отец Прокопий овдовел. Служба и многочисленные обязанности помогли священнику не впасть в уныние, пройти сквозь скорбь и выйти к свету.

В августе 1917 года священник Прокопий Попов был возведен в сан протоиерея.

Сколько было уже сделано и сколько, возможно, было планов на будущее. Но новая власть изменила всё. Ещё задолго до революции 1917 года отец Прокопий предвидел все ужасы, надвигающиеся на страну и Церковь. Он об этом неоднократно говорил прихожанам.
В апреле 18-го года на протоиерея Прокопия была наложена контрибуция, как на представителя эксплуатирующего класса в размере 7 тысяч рублей, которую требовали взыскать немедленно. Это были огромные деньги. Но и этого было мало. Выбрав мишенью духовенство, новые власти с ожесточением продолжали творить беззаконие.
13 октября 1918 года организованный большевиками карательный отряд явился в село Шолгу и арестовал отца Прокопия по подозрению в контрреволюционной деятельности. Посреди поля была вырыта яма, из деревни согнаны местные жители. По некоторым данным могилу было приказано вырыть самому о. Прокопию. Уверенные в своей безнаказанности, красноармейцы совершали своё преступление открыто перед людьми.

Отца Прокопия убили без суда и следствия.

Похоронили священника здесь же, на месте казни. Позже, сыновья перезахоронили тело мученика на сельском кладбище.

Священномученик Прокопий Попов был причислен к лику святых новомучеников и исповедников в августе 2000 года.